Course Name Year Term Period Faculty / Graduate School All Instructors Credits
30189:[2025 Spring]Functional Genomics (M) 2025 Spring Mon4 College　of　Life　Sciences KIKUCHI TAKESHI 2

Campus

BKC

Class Venue

Forest202

Language

日本語

Course Outline and Method

様々な生物種のゲノムが解読されつつあり、膨大なゲノムデータが蓄積されつつある。しかしながら我々が手にしているのは、各生物種に存在する全タンパクのアミノ酸配列のみである。ゲノム情報を実りあるものにするためには、そこからタンパクの機能に関する情報を抽出しなければならない。機能ゲノミクスは、ゲノム情報にある全タンパクの機能を把握することを目的とする学問分野である。本講義では、特にバイオインフォマティクス的手法によるタンパクの機能予測に関して概説する。

Student Attainment Objectives

１．機能予測のためのアミノ酸配列の解析法について把握する。
２．タンパク機能と立体構造の関係について理解する。
３．タンパクの分子進化と機能との関係について理解する。

Recommended Preparatory Course

特になし

Course Schedule

Lecture/Instructor（When there are multiple instructors) Theme
Keyword, References and Supplementary Information
菊地

本科目は+R授業対象科目。第15回に+R授業を実施。詳細はmanaba+Rを参照

タンパク質の構造と創薬について

1／菊地

1
機能ゲノミクスとバイオインフォマティクス

タンパク質、バイオインフォマティクス、生化学的機能、生物学的機能

2／菊地

2
相同タンパク質と分子進化

ファミリー、スーパーファミリー、立体構造と進化、PAM行列

3／菊地

3
生化学的機能と進化

機能の保存、保存アミノ酸、配列モチーフ

4／菊地

4
立体構造と機能

立体構造と進化、構造と機能

5／菊地

5
アミノ酸配列解析（１）

データベース、アラインメント

6／菊地

6
アミノ酸配列解析（２）

モチーフによる解析、活性残基と構造安定性

7／菊地

7
系統樹を利用した機能解析（１）

ドラッグデザイン

8／菊地

8
系統樹を利用した機能解析（2）

ホモロジーモデリング、ニューラルネットワーク

9／菊地

9
相同配列解析法の基礎

情報量、機能残基クラスター

10／菊地

10
相同配列解析法による機能部位同定

相互作用残基、接触残基

11／菊地

11
タンパク間相互作用と機能

酵素反応、共進化

12／菊地

12
タンパク間相互作用の予測（１）

ドメイン、系統プロファイル

13／菊地

13
タンパク間相互作用の予測（２）

ジョイント法、プロテオミクス

14／菊地

14
進化情報とバイオインフォマティクス、タンパク構造

クラスタリング、分子進化学

Class Format

対面講義を1４回実施する。

Recommendations for Private Study

講義中にキーワードを指定するので、その意味の把握に努めること。

Grade Evaluation Method

Kind Percentage Grading Criteria etc.
Final Examination (Written) 80

タンパクアミノ酸配列と構造・機能の関連についての理解を評価する。

Report Examination
(A report to be submitted by the unified deadline)		 0

Exams and/or Reports other than those stated above, and Continuous Assessment　
(Evaluation of Everyday Performance in Class)		 20

タンパクアミノ酸配列と構造・機能の関連についての理解を評価する。

上記以外の試験・レポート、平常点評価（日常的な授業における取組状況の評価） 30%
講義内にて2～４回分のレポートを課す。総合的に評価する。

Grade Evaluation Method （Note）

Advice to Students on Study and Research Methods

講義中に指定したキーワードを中心にして理解の巾を少しずつ広げる努力をすること。

Textbooks

Textbooks （Frequency of Use, Note）

特になし

Reference Books

Title Author Publisher ISBN Code Comment
タンパク質機能解析のためのバイオインフォマティクス 藤博幸 講談社サイエンティフィク 4061538551

Reference Books （Frequency of Use, Note）

特になし

Web Pages for Reference

特になし

How to Communicate with the Instructor In and Out of Class(Including Instructor Contact Information)

Communication Paper,Talk with Students

Other Comments

特になし
【科目ナンバリング・カリキュラムマップはこちらから/Click here to see the Curriculum-Map and Course-Numbering】
URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/