授業科目名 年度 学期 開講曜日・時限 学部・研究科 全担当教員 単位数
33913:バイオインフォマティクス(MA) 2023 春セメスター 火3 生命科学部 伊藤 將弘 2

キャンパス

BKC

授業施設

コラーニングⅠ　１０２号教室

授業で利用する言語

日本語

授業の概要と方法

生命科学分野において、バイオインフォマティクスの必要性はますます強まっている。本講義では、バイオインフォマティクスとはどのような分野なのか、何の役に立つのか、どのように発展していくのかなど、初心者にわかりやすく紹介する。

原則、１回目を含めて対面授業で実施する。ただし、感染拡大状況によりWEB授業等に変更する場合があるので、その場合は、manaba+Rを通じて改めて指示するので随時確認すること。

受講生の到達目標

バイオインフォマティクスとは何かを俯瞰的に把握し、その原理および応用についても理解する。将来の選択肢の一つとして、バイオインフォマティクスに関わることを念頭に置いて、今すべき学習を独自に進められるようになる。

事前に履修しておくことが望まれる科目

分子生物学関連の基礎科目を受講していることが望ましい．

授業スケジュール

授業回数/
担当教員（複数担当の場合） 		テーマ
キーワード・文献・補足事項等
1

バイオインフォマティクスとはなにか？

導入

2

バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎

細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型

3

配列解析

相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測

4

分子系統解析

遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹

5

タンパク質の立体構造解析（１）

タンパク質立体構造、分類、比較

6

タンパク質の立体構造解析（２）

タンパク質立体構造、分類、比較

7

次世代シーケンサー（NGS）データ概論

次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例

8

ゲノム解析

ゲノムの特徴、比較ゲノム

9

トランスクリプトーム解析

マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析

10

NGSを用いた応用解析

エピゲノム解析、メタゲノム解析

11

プロテオーム解析

インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス

12

データベース

データベースの歴史、データ形式、使い方

13

フェノーム解析（１）

バイオイメージインフォマティクス

14

フェノーム解析（２）

バイオイメージインフォマティクス

15

人工知能

機械学習、ニューラルネットワーク、深層学習

授業実施形態

BCP停止の場合は、BCPレベル0～2の記載どおりに授業が行われます。
During the suspension period of BCP, classes will be as described in BCP levels 0-2.

BCPレベル1～2の場合、対面授業で実施する。ただし、BCPレベル1～2であっても感染状況の悪化や不測の事態を考慮して、BCP3～4の対応をする場合もありうる。詳細はmanaba+Rにて連絡する。
BCPレベル3～4となった場合には、対面授業の代わりにWebでのリアルタイム授業を実施する。詳細はmanaba+Rにて連絡する。

授業外学習の指示

毎回の授業で参考図書・文献を示す。
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。

成績評価方法

種別 割合(%) 評価基準等
定期試験（筆記） 70

定期試験で評価する
レポート試験
（統一締切日を締切とするレポート）		 0

上記以外の試験・レポート、平常点評価
（日常的な授業における取組状況の評価）		 30

主に参加状況と授業態度で評価する

成績評価方法(備考)

定期試験が実施できなかった場合は、レポートにて評価する。

受講および研究に関するアドバイス

講義内容が広範囲に及ぶため復習することが望ましい。

教科書

書名 著者 出版社 ISBNコード 備考
よくわかるバイオインフォマティクス入門 藤　博幸 講談社 978-4-06-513821-2

教科書(使用頻度、その他補足)

参考書

参考書(使用頻度、その他補足)

参考になるwwwページ

授業内外における学生・教員間のコミュニケーションの方法

manaba+R,その他(教員より別途指示）

備考

【科目ナンバリング・カリキュラムマップはこちらから/Click here to see the Curriculum-Map and Course-Numbering】
URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/