Course Name Year Term Period Faculty / Graduate School All Instructors Credits
33913:Bioinformatics (MA) 2023 Spring Tue3 College　of　Life　Sciences ITO MASAHIRO 2

Campus

BKC

Class Venue

Co-learning102

Language

Japanese

Course Outline and Method

生命科学分野において、バイオインフォマティクスの必要性はますます強まっている。本講義では、バイオインフォマティクスとはどのような分野なのか、何の役に立つのか、どのように発展していくのかなど、初心者にわかりやすく紹介する。

原則、１回目を含めて対面授業で実施する。ただし、感染拡大状況によりWEB授業等に変更する場合があるので、その場合は、manaba+Rを通じて改めて指示するので随時確認すること。

Student Attainment Objectives

バイオインフォマティクスとは何かを俯瞰的に把握し、その原理および応用についても理解する。将来の選択肢の一つとして、バイオインフォマティクスに関わることを念頭に置いて、今すべき学習を独自に進められるようになる。

Recommended Preparatory Course

分子生物学関連の基礎科目を受講していることが望ましい．

Course Schedule

Lecture/Instructor（When there are multiple instructors) Theme
Keyword, References and Supplementary Information
1

バイオインフォマティクスとはなにか？

導入

2

バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎

細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型

3

配列解析

相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測

4

分子系統解析

遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹

5

タンパク質の立体構造解析（１）

タンパク質立体構造、分類、比較

6

タンパク質の立体構造解析（２）

タンパク質立体構造、分類、比較

7

次世代シーケンサー（NGS）データ概論

次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例

8

ゲノム解析

ゲノムの特徴、比較ゲノム

9

トランスクリプトーム解析

マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析

10

NGSを用いた応用解析

エピゲノム解析、メタゲノム解析

11

プロテオーム解析

インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス

12

データベース

データベースの歴史、データ形式、使い方

13

フェノーム解析（１）

バイオイメージインフォマティクス

14

フェノーム解析（２）

バイオイメージインフォマティクス

15

人工知能

機械学習、ニューラルネットワーク、深層学習

Class Format

BCP停止の場合は、BCPレベル0～2の記載どおりに授業が行われます。
During the suspension period of BCP, classes will be as described in BCP levels 0-2.

BCPレベル1～2の場合、対面授業で実施する。ただし、BCPレベル1～2であっても感染状況の悪化や不測の事態を考慮して、BCP3～4の対応をする場合もありうる。詳細はmanaba+Rにて連絡する。
BCPレベル3～4となった場合には、対面授業の代わりにWebでのリアルタイム授業を実施する。詳細はmanaba+Rにて連絡する。

Recommendations for Private Study

毎回の授業で参考図書・文献を示す。
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。

Grade Evaluation Method

Kind Percentage Grading Criteria etc.
Final Examination (Written) 70

定期試験で評価する
Report Examination
(A report to be submitted by the unified deadline)		 0

Exams and/or Reports other than those stated above, and Continuous Assessment　
(Evaluation of Everyday Performance in Class)		 30

主に参加状況と授業態度で評価する

Grade Evaluation Method （Note）

定期試験が実施できなかった場合は、レポートにて評価する。

Advice to Students on Study and Research Methods

講義内容が広範囲に及ぶため復習することが望ましい。

Textbooks

Title Author Publisher ISBN Code Comment
よくわかるバイオインフォマティクス入門 藤　博幸 講談社 978-4-06-513821-2

Textbooks （Frequency of Use, Note）

Reference Books

Reference Books （Frequency of Use, Note）

Web Pages for Reference

How to Communicate with the Instructor In and Out of Class(Including Instructor Contact Information)

Learning Management System （manaba+R）,Other (Separate instructions will be provided)

Other Comments

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