立命館大学シラバス

授業科目名	年度	学期	開講曜日・時限	学部・研究科	全担当教員	単位数
30146:バイオインフォマティクス(MB) § 30147:バイオインフォマティクス(Y)	2024	秋セメスター	火4	生命科学部,薬学部	塩生くらら、冨樫祐一	2

キャンパス

BKC

授業施設

コラーニングⅠ　３０４号教室

授業で利用する言語

日本語

授業の概要と方法

生命科学分野において、バイオインフォマティクスの必要性はますます強まっている。本講義では、バイオインフォマティクスとはどのような分野なのか、何の役に立つのか、どのように発展していくのかなど、初心者にわかりやすく紹介する。

授業実施形態：対面＋オンデマンド型
・オンデマンド型授業回は、manaba+Rで質問を受け付ける。

受講生の到達目標

バイオインフォマティクスとは何かを俯瞰的に把握し、その原理および応用についても理解する。将来の選択肢の一つとして、バイオインフォマティクスに関わることを念頭に置いて、今すべき学習を独自に進められるようになる。

事前に履修しておくことが望まれる科目

分子生物学関連の基礎科目を受講していることが望ましい．

授業スケジュール

授業回数/ 担当教員（複数担当の場合）	テーマ
授業回数/ 担当教員（複数担当の場合）	キーワード・文献・補足事項等
1 / 塩生	バイオインフォマティクスとはなにか？
1 / 塩生	導入授業実施形態：対面
2 / 塩生	バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎
2 / 塩生	細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型授業実施形態：対面
3 / 塩生	配列解析
3 / 塩生	相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測授業実施形態：対面
4 / 塩生	分子系統解析
4 / 塩生	遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹授業実施形態：対面
5 / 塩生	タンパク質の立体構造解析（１）
5 / 塩生	タンパク質立体構造、分類、比較授業実施形態：対面
6 / 塩生	タンパク質の立体構造解析（２）
6 / 塩生	タンパク質立体構造、分類、比較授業実施形態：対面
7 / 塩生	次世代シーケンサー（NGS）データ概論
7 / 塩生	次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例授業実施形態：対面
8 / 塩生	ゲノム解析
8 / 塩生	ゲノムの特徴、比較ゲノム授業実施形態：対面
9 / 塩生	トランスクリプトーム解析
9 / 塩生	マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析授業実施形態：対面
10 / 塩生	NGSを用いた応用解析
10 / 塩生	エピゲノム解析、メタゲノム解析授業実施形態：対面
11 / 塩生	プロテオーム解析
11 / 塩生	インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス授業実施形態：対面
12 / 塩生	データベース
12 / 塩生	データベースの歴史、データ形式、使い方授業実施形態：対面
13 / 冨樫	フェノーム解析（１）
13 / 冨樫	バイオイメージインフォマティクス授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）
14 / 冨樫	フェノーム解析（２）
14 / 冨樫	バイオイメージインフォマティクス授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）
15 / 冨樫	人工知能
15 / 冨樫	機械学習、ニューラルネットワーク、深層学習授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）

授業実施形態

授業スケジュールに示した通り、対面授業12回とオンデマンド型授業（動画配信）3回を実施する。
平常点評価として小テストを出題する。

授業外学習の指示

毎回の授業で参考図書・文献を示す。
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。

成績評価方法

種別	割合(%)	評価基準等
定期試験（筆記）	70	定期試験で評価する。
レポート試験（統一締切日を締切とするレポート）	0
上記以外の試験・レポート、平常点評価（日常的な授業における取組状況の評価）	30	主に参加状況と授業態度で評価する。

成績評価方法(備考)

受講および研究に関するアドバイス

講義内容が広範囲に及ぶため復習することが望ましい。

教科書

書名	著者	出版社	ISBNコード	備考
よくわかるバイオインフォマティクス入門	藤　博幸	講談社	978-4-06-513821-2

教科書(使用頻度、その他補足)

参考書

参考書(使用頻度、その他補足)

参考になるwwwページ

授業内外における学生・教員間のコミュニケーションの方法

manaba+R,その他(教員より別途指示）

備考

【科目ナンバリング・カリキュラムマップはこちらから/Click here to see the Curriculum-Map and Course-Numbering】
URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/