Course Name Year Term Period Faculty / Graduate School All Instructors Credits
30146:Bioinformatics (MB) § 30147:Bioinformatics (Y) 2024 Fall Tue4 College　of　Life　Sciences,College　of　Pharmaceutical　Sciences SHIONYU CLARA、TOGASHI YUICHI 2

Campus

BKC

Class Venue

Co-learning304

Language

日本語

Course Outline and Method

生命科学分野において、バイオインフォマティクスの必要性はますます強まっている。本講義では、バイオインフォマティクスとはどのような分野なのか、何の役に立つのか、どのように発展していくのかなど、初心者にわかりやすく紹介する。

授業実施形態：対面＋オンデマンド型
・オンデマンド型授業回は、manaba+Rで質問を受け付ける。

Student Attainment Objectives

バイオインフォマティクスとは何かを俯瞰的に把握し、その原理および応用についても理解する。将来の選択肢の一つとして、バイオインフォマティクスに関わることを念頭に置いて、今すべき学習を独自に進められるようになる。

Recommended Preparatory Course

分子生物学関連の基礎科目を受講していることが望ましい．

Course Schedule

Lecture/Instructor（When there are multiple instructors) Theme
Keyword, References and Supplementary Information
1 / 塩生

バイオインフォマティクスとはなにか？

導入
授業実施形態：対面

2 / 塩生

バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎

細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型
授業実施形態：対面

3 / 塩生

配列解析

相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測
授業実施形態：対面

4 / 塩生

分子系統解析

遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹
授業実施形態：対面

5 / 塩生

タンパク質の立体構造解析（１）

タンパク質立体構造、分類、比較
授業実施形態：対面

6 / 塩生

タンパク質の立体構造解析（２）

タンパク質立体構造、分類、比較
授業実施形態：対面

7 / 塩生

次世代シーケンサー（NGS）データ概論

次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例
授業実施形態：対面

8 / 塩生

ゲノム解析

ゲノムの特徴、比較ゲノム
授業実施形態：対面

9 / 塩生

トランスクリプトーム解析

マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析
授業実施形態：対面

10 / 塩生

NGSを用いた応用解析

エピゲノム解析、メタゲノム解析
授業実施形態：対面

11 / 塩生

プロテオーム解析

インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス
授業実施形態：対面

12 / 塩生

データベース

データベースの歴史、データ形式、使い方
授業実施形態：対面

13 / 冨樫

フェノーム解析（１）

バイオイメージインフォマティクス
授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）

14 / 冨樫

フェノーム解析（２）

バイオイメージインフォマティクス
授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）

15 / 冨樫

人工知能

機械学習、ニューラルネットワーク、深層学習
授業実施形態：オンデマンド型（動画配信・manaba+R上でURLを告知する）

Class Format

授業スケジュールに示した通り、対面授業12回とオンデマンド型授業（動画配信）3回を実施する。
平常点評価として小テストを出題する。

Recommendations for Private Study

毎回の授業で参考図書・文献を示す。
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。

Grade Evaluation Method

Kind Percentage Grading Criteria etc.
Final Examination (Written) 70

定期試験で評価する。
Report Examination
(A report to be submitted by the unified deadline)		 0

Exams and/or Reports other than those stated above, and Continuous Assessment　
(Evaluation of Everyday Performance in Class)		 30

主に参加状況と授業態度で評価する。

Grade Evaluation Method （Note）

Advice to Students on Study and Research Methods

講義内容が広範囲に及ぶため復習することが望ましい。

Textbooks

Title Author Publisher ISBN Code Comment
よくわかるバイオインフォマティクス入門 藤　博幸 講談社 978-4-06-513821-2

Textbooks （Frequency of Use, Note）

Reference Books

Reference Books （Frequency of Use, Note）

Web Pages for Reference

How to Communicate with the Instructor In and Out of Class(Including Instructor Contact Information)

Learning Management System （manaba+R）,Other (Separate instructions will be provided)

Other Comments

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URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/