Course Name Year Term Period Faculty / Graduate School All Instructors Credits
30190:[2025 Spring]Biosimulation (M) 2025 Spring Wed2 College of Life Sciences AMANO AKIRA 2

Campus

BKC

Class Venue

Computer Training Room

Language

日本語

Course Outline and Method

生体機能の仕組みをコンピュータ上に再現し、解析する技術について概説する。本講義では心筋の働きを理解することを目指し、そのために必要な生体機能要素の原理について解説を行う。また、学生自らシミュレーターを実行し、課題を行うことで、生体のダイナミズムの直観的な理解を促す。本科目の授業実施形態:対面

Student Attainment Objectives

(1) 生体機能のシミュレーションについて、その基本的な計算手法を説明することができる。
(2) 自ら簡単な分子機能をコンピュータ上に再現できる。

Recommended Preparatory Course

計算機科学全般と生命科学全般

Course Schedule

Lecture/Instructor(When there are multiple instructors) Theme
Keyword, References and Supplementary Information

本科目は+R授業対象科目。第1回に+R授業を実施。詳細はmanaba+Rを参照

1 天野

1回
 細胞機能シミュレータを使ってみる (1)

「ヒト心室筋細胞モデル」を使って細胞の働きをコンピュータ上で観察する(対面で実施)

2 天野

2回
細胞機能シミュレータを使ってみる (2)

「ペースメーカ細胞モデル」を使って細胞の働きをコンピュータ上で観察する。

3 天野

3回
コンピュータ画面にグラフを描く

VBでプログラムを描く方法

4 天野

4回
酵素反応 (1)

酵素反応を決定する反応速度定数

5 天野

5回
酵素反応 (2)

酵素反応を決定する反応速度定数の決定

6 天野

6回
酵素反応 (3)

酵素阻害 、拮抗阻害、非拮抗阻害

7 天野

7回
細胞電気現象 (1)

電気回路モデルを使った電位変化の理解

8 天野

8回
細胞電気現象 (2)

水柱モデルを使った水位変化の理解

9 天野

9回
細胞電気現象 (3)

簡略心筋細胞モデルを使った平衡電位と膜電位の理解

10 天野

10回
電気回路コンダクタンス自動制御(1)

電気シグナルの作成

11 天野

11回
電気回路コンダクタンス自動制御(2)

自動制御の電気シグナル

12 天野

12回
電気回路コンダクタンス自動制御(3)

膜電位依存性チャネル

13 天野

13回
イオンチャネル

Kチャネル、Caチャネル

14 天野

14回
イオントランスポーター

NaKポンプ

Class Format

原則として対面形式で実施する

Recommendations for Private Study

配布するプログラムを用いた講義内容とプログラミングの復習を2時間程度行うこと。

Grade Evaluation Method

Kind Percentage Grading Criteria etc.
Final Examination (Written) 0

Report Examination
(A report to be submitted by the unified deadline)
0

Exams and/or Reports other than those stated above, and Continuous Assessment 
(Evaluation of Everyday Performance in Class)
100

講義内容に関するレポート課題を出題する。レポートでは、自ら実行したシミュレーション結果に対する解説をもって理解度を評価する。また、授業内で小テストを行い、平常点として評価する。

Grade Evaluation Method (Note)

Advice to Students on Study and Research Methods

Textbooks

Textbooks (Frequency of Use, Note)

配布するテキストとモデルプログラムを使って勉強する。

Reference Books

Title Author Publisher ISBN Code Comment
simBio 皿井伸明 京都通信社 4-903473-00-7
心筋細胞フィジオーム理解のための電子教科書“e-Heart” 野間昭典他 丸善雄松堂 9784907027209
心機能フィジオーム理解のための電子教科書"e-Heart" 野間昭典他 丸善雄松堂 9784907027278

Reference Books (Frequency of Use, Note)

Web Pages for Reference

How to Communicate with the Instructor In and Out of Class(Including Instructor Contact Information)

Talk with Students,Other (Separate instructions will be provided)

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