| Course Name | Year | Term | Period | Faculty / Graduate School | All Instructors | Credits |
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| 30137:[2025 Spring]Bioinformatics (MB) § 30138:Bioinformatics (Y) | 2025 | Spring | Mon2 | College of Life Sciences,College of Pharmaceutical Sciences | ITO MASAHIRO | 2 |
Campus
Class Venue
Language
Course Outline and Method
授業実施形態:対面、Web、オンデマンド
Student Attainment Objectives
Recommended Preparatory Course
Course Schedule
| Lecture/Instructor(When there are multiple instructors) | Theme |
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| Keyword, References and Supplementary Information | |
本科目は+R授業対象科目。第14回に+R授業を実施。詳細はmanaba+Rを参照 |
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| 1 | バイオインフォマティクスとはなにか? |
導入
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| 2 | バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎 |
細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型
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| 3 | ゲストスピーカー:大浪修一(理研・チームリーダー) |
Web |
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| 4 | 配列解析 |
相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測
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| 5 | 分子系統解析 |
遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹
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| 6 | タンパク質の立体構造解析(1) |
タンパク質立体構造、分類、比較
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| 7 | タンパク質の立体構造解析(2) |
タンパク質立体構造、分類、比較
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| 8 | 次世代シーケンサー(NGS)データ概論 |
次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例
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| 9 | ゲノム解析 |
ゲノムの特徴、比較ゲノム
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| 10 | トランスクリプトーム解析 |
マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析
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| 11 | NGSを用いた応用解析 |
エピゲノム解析、メタゲノム解析
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| 12 | プロテオーム解析 |
インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス
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| 13 | データベース |
データベースの歴史、データ形式、使い方
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| 14 | フェノーム解析 |
バイオイメージインフォマティクス
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Class Format
Recommendations for Private Study
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。
Grade Evaluation Method
| Kind | Percentage | Grading Criteria etc. |
|---|---|---|
| Final Examination (Written) | 70 | 定期試験で評価する。 |
| Report Examination (A report to be submitted by the unified deadline) |
0 | |
| Exams and/or Reports other than those stated above, and Continuous Assessment (Evaluation of Everyday Performance in Class) |
30 | 主に参加状況と授業態度、レポート、小テストで評価する。 |
Grade Evaluation Method (Note)
Advice to Students on Study and Research Methods
Textbooks
| Title | Author | Publisher | ISBN Code | Comment |
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| よくわかるバイオインフォマティクス入門 | 藤 博幸 | 講談社 | 978-4-06-513821-2 |
Textbooks (Frequency of Use, Note)
Reference Books
Reference Books (Frequency of Use, Note)
Web Pages for Reference
How to Communicate with the Instructor In and Out of Class(Including Instructor Contact Information)
Other Comments
URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/