授業科目名 年度 学期 開講曜日・時限 学部・研究科 全担当教員 単位数
30136:[2025 秋セメスター]バイオインフォマティクス(MA) 2025 秋セメスター 木1 生命科学部 塩生 くらら、冨樫 祐一 2

キャンパス

BKC

授業施設

コラーニングⅠ 102号教室

授業で利用する言語

日本語

授業の概要と方法

生命科学分野において、バイオインフォマティクスの必要性はますます強まっている。本講義では、バイオインフォマティクスとはどのような分野なのか、何の役に立つのか、どのように発展していくのかなど、初心者にわかりやすく紹介する。

受講生の到達目標

バイオインフォマティクスとは何かを俯瞰的に把握し、その原理および応用についても理解する。将来の選択肢の一つとして、バイオインフォマティクスに関わることを念頭に置いて、今すべき学習を独自に進められるようになる。

事前に履修しておくことが望まれる科目

分子生物学関連の基礎科目を受講していることが望ましい.

授業スケジュール

授業回数/
担当教員(複数担当の場合)
テーマ
キーワード・文献・補足事項等

本科目は+R授業対象科目。第12回に+R授業を実施。詳細はmanaba+Rを参照

1 / 塩生

バイオインフォマティクスを学ぶための分子生物学基礎

導入
細胞、ゲノム、DNA、遺伝子、mRNA、アミノ酸、タンパク質、表現型
授業実施形態:対面

2 / 塩生

配列解析

相同タンパク質、機能の保存とモチーフ、アラインメント、機能予測
授業実施形態:対面

3 / 塩生

分子系統解析

遺伝子多様化の分子機構、分子系統樹
授業実施形態:対面

4 / 塩生

タンパク質の立体構造解析(1)

タンパク質立体構造、分類、比較
授業実施形態:対面

5 / 塩生

タンパク質の立体構造解析(2)

タンパク質立体構造、分類、比較
授業実施形態:対面

6 / 塩生

次世代シーケンサー(NGS)データ概論

次世代シーケンサー、原理、データの特徴、利用例
授業実施形態:対面

7 / 塩生

ゲノム解析

ゲノムの特徴、比較ゲノム
授業実施形態:対面

8 / 塩生

トランスクリプトーム解析

マイクロアレイ技術、RNAseq解析、ncRNA解析
授業実施形態:対面

9 / 塩生

NGSを用いた応用解析

エピゲノム解析、メタゲノム解析
授業実施形態:対面

10 / 塩生

プロテオーム解析

インタラクトーム解析、プロテオーム同定、計算プロテオミクス
授業実施形態:対面

11 / 塩生

データベース

データベースの歴史、データ形式、使い方
授業実施形態:対面

+R授業 / 冨樫

導入(補足)

そもそもbioinformaticsとは?

12 / 冨樫

フェノーム解析 (1)

バイオイメージインフォマティクス(導入)、画像取得、画像処理、定量解析
授業実施形態:オンデマンド型(動画配信・manaba+R上でURLを告知する)

13 / 冨樫

フェノーム解析 (2)

人工知能、機械学習、ニューラルネットワーク、深層学習
授業実施形態:オンデマンド型(動画配信・manaba+R上でURLを告知する)

14 / 冨樫

フェノーム解析 (3)

画像取得・解析に関連した技術、画像解析・機械学習の応用例
授業実施形態:オンデマンド型(動画配信・manaba+R上でURLを告知する)

授業実施形態

授業スケジュールに示した通り、対面授業11回とオンデマンド型授業(動画配信)3回を実施する。

授業外学習の指示

毎回の授業で参考図書・文献を示す。
本授業の内容を理解し、知見を広めるには参考図書・文献に当たり、積極的な授業外の学習を進め、予習・復習する姿勢が望まれる。

成績評価方法

種別 割合(%) 評価基準等
定期試験(筆記) 70

授業で扱った内容について、定期試験で評価する。

レポート試験
(統一締切日を締切とするレポート)
0

上記以外の試験・レポート、平常点評価
(日常的な授業における取組状況の評価)
30

授業への参加状況で評価する。
オンデマンド配信の回では、授業内容についての小テストで評価する。

成績評価方法(備考)

受講および研究に関するアドバイス

講義内容が広範囲に及ぶため復習することが望ましい。

教科書

書名 著者 出版社 ISBNコード 備考
よくわかるバイオインフォマティクス入門 藤 博幸 講談社 978-4-06-513821-2

教科書(使用頻度、その他補足)

参考書

参考書(使用頻度、その他補足)

参考になるwwwページ

授業内外における学生・教員間のコミュニケーションの方法

manaba+R,その他(教員より別途指示)

備考

【科目ナンバリング・カリキュラムマップはこちらから/Click here to see the Curriculum-Map and Course-Numbering】
URL:https://secure.ritsumei.ac.jp/students/pathways-future/course/curriculum.html/